Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms