Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcad1Q04692 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Smarcad1Q04692 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms