Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms