Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.8 ms