Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Epha4Q03137 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Epha4Q03137 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms