Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdcd1Q02242 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms