Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ly9Q01965 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ly9Q01965 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ly9Q01965 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ly9Q01965 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ly9Q01965 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ly9Q01965 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ly9Q01965 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ly9Q01965 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms