Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VcpQ01853 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VcpQ01853 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
VcpQ01853 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VcpQ01853 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VcpQ01853 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VcpQ01853 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VcpQ01853 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VcpQ01853 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VcpQ01853 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VcpQ01853 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VcpQ01853 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VcpQ01853 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VcpQ01853 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VcpQ01853 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VcpQ01853 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VcpQ01853 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VcpQ01853 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VcpQ01853 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VcpQ01853 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VcpQ01853 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VcpQ01853 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VcpQ01853 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VcpQ01853 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VcpQ01853 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VcpQ01853 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VcpQ01853 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VcpQ01853 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VcpQ01853 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VcpQ01853 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VcpQ01853 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VcpQ01853 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
VcpQ01853 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VcpQ01853 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
VcpQ01853 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VcpQ01853 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VcpQ01853 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms