Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Top2aQ01320 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Top2aQ01320 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Top2aQ01320 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Top2aQ01320 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Top2aQ01320 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Top2aQ01320 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Top2aQ01320 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Top2aQ01320 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Top2aQ01320 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Top2aQ01320 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Top2aQ01320 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Top2aQ01320 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Top2aQ01320 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Top2aQ01320 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.85
Top2aQ01320 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Top2aQ01320 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Top2aQ01320 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Top2aQ01320 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Top2aQ01320 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Top2aQ01320 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Top2aQ01320 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Top2aQ01320 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Top2aQ01320 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Top2aQ01320 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Top2aQ01320 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Top2aQ01320 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Top2aQ01320 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Top2aQ01320 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Top2aQ01320 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Top2aQ01320 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Top2aQ01320 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Top2aQ01320 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Top2aQ01320 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Top2aQ01320 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Top2aQ01320 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Top2aQ01320 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Top2aQ01320 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Top2aQ01320 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Top2aQ01320 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Top2aQ01320 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Top2aQ01320 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Top2aQ01320 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Top2aQ01320 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Top2aQ01320 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Top2aQ01320 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Top2aQ01320 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Top2aQ01320 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Top2aQ01320 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Top2aQ01320 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Top2aQ01320 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Top2aQ01320 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Top2aQ01320 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Top2aQ01320 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Top2aQ01320 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Top2aQ01320 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Top2aQ01320 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Top2aQ01320 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Top2aQ01320 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Top2aQ01320 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Top2aQ01320 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Top2aQ01320 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Top2aQ01320 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Top2aQ01320 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Top2aQ01320 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Top2aQ01320 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Top2aQ01320 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Top2aQ01320 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Top2aQ01320 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Top2aQ01320 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Top2aQ01320 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Top2aQ01320 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Top2aQ01320 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Top2aQ01320 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Top2aQ01320 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Top2aQ01320 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Top2aQ01320 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Top2aQ01320 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Top2aQ01320 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Top2aQ01320 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Top2aQ01320 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Top2aQ01320 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Top2aQ01320 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Top2aQ01320 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Top2aQ01320 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Top2aQ01320 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Top2aQ01320 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Top2aQ01320 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Top2aQ01320 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Top2aQ01320 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Top2aQ01320 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Top2aQ01320 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Top2aQ01320 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Top2aQ01320 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Top2aQ01320 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Top2aQ01320 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Top2aQ01320 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Top2aQ01320 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Top2aQ01320 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Top2aQ01320 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms