Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EgfrQ01279 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EgfrQ01279 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EgfrQ01279 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EgfrQ01279 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EgfrQ01279 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EgfrQ01279 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EgfrQ01279 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EgfrQ01279 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EgfrQ01279 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EgfrQ01279 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EgfrQ01279 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EgfrQ01279 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
EgfrQ01279 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
EgfrQ01279 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EgfrQ01279 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EgfrQ01279 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EgfrQ01279 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EgfrQ01279 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EgfrQ01279 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EgfrQ01279 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EgfrQ01279 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EgfrQ01279 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EgfrQ01279 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EgfrQ01279 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EgfrQ01279 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EgfrQ01279 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EgfrQ01279 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EgfrQ01279 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EgfrQ01279 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EgfrQ01279 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EgfrQ01279 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EgfrQ01279 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EgfrQ01279 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EgfrQ01279 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EgfrQ01279 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EgfrQ01279 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
EgfrQ01279 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EgfrQ01279 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EgfrQ01279 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EgfrQ01279 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
EgfrQ01279 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EgfrQ01279 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EgfrQ01279 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EgfrQ01279 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EgfrQ01279 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EgfrQ01279 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EgfrQ01279 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EgfrQ01279 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EgfrQ01279 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EgfrQ01279 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EgfrQ01279 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EgfrQ01279 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EgfrQ01279 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EgfrQ01279 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EgfrQ01279 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EgfrQ01279 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EgfrQ01279 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EgfrQ01279 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EgfrQ01279 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EgfrQ01279 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EgfrQ01279 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EgfrQ01279 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EgfrQ01279 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EgfrQ01279 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EgfrQ01279 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EgfrQ01279 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EgfrQ01279 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EgfrQ01279 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EgfrQ01279 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EgfrQ01279 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EgfrQ01279 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EgfrQ01279 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EgfrQ01279 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EgfrQ01279 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EgfrQ01279 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EgfrQ01279 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EgfrQ01279 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EgfrQ01279 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EgfrQ01279 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EgfrQ01279 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms