Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SelpQ01102 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SelpQ01102 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SelpQ01102 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SelpQ01102 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SelpQ01102 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SelpQ01102 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SelpQ01102 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SelpQ01102 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SelpQ01102 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SelpQ01102 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SelpQ01102 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SelpQ01102 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SelpQ01102 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SelpQ01102 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SelpQ01102 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SelpQ01102 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SelpQ01102 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SelpQ01102 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SelpQ01102 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SelpQ01102 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SelpQ01102 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SelpQ01102 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SelpQ01102 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SelpQ01102 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SelpQ01102 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SelpQ01102 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SelpQ01102 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SelpQ01102 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SelpQ01102 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SelpQ01102 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SelpQ01102 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SelpQ01102 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SelpQ01102 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SelpQ01102 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SelpQ01102 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SelpQ01102 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SelpQ01102 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SelpQ01102 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SelpQ01102 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SelpQ01102 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SelpQ01102 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SelpQ01102 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SelpQ01102 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SelpQ01102 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SelpQ01102 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SelpQ01102 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SelpQ01102 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SelpQ01102 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SelpQ01102 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SelpQ01102 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SelpQ01102 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SelpQ01102 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SelpQ01102 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SelpQ01102 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SelpQ01102 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SelpQ01102 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SelpQ01102 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SelpQ01102 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SelpQ01102 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SelpQ01102 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SelpQ01102 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SelpQ01102 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SelpQ01102 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SelpQ01102 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SelpQ01102 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SelpQ01102 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SelpQ01102 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SelpQ01102 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SelpQ01102 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SelpQ01102 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SelpQ01102 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SelpQ01102 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SelpQ01102 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SelpQ01102 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SelpQ01102 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SelpQ01102 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SelpQ01102 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.7 ms