Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Grin2cQ01098 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms