Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Grin2bQ01097 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Grin2bQ01097 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Grin2bQ01097 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Grin2bQ01097 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Grin2bQ01097 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Grin2bQ01097 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Grin2bQ01097 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Grin2bQ01097 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Grin2bQ01097 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Grin2bQ01097 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Grin2bQ01097 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Grin2bQ01097 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Grin2bQ01097 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Grin2bQ01097 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Grin2bQ01097 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Grin2bQ01097 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Grin2bQ01097 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Grin2bQ01097 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Grin2bQ01097 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Grin2bQ01097 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Grin2bQ01097 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Grin2bQ01097 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Grin2bQ01097 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Grin2bQ01097 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Grin2bQ01097 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Grin2bQ01097 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Grin2bQ01097 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Grin2bQ01097 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Grin2bQ01097 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Grin2bQ01097 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Grin2bQ01097 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Grin2bQ01097 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Grin2bQ01097 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Grin2bQ01097 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Grin2bQ01097 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Grin2bQ01097 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Grin2bQ01097 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Grin2bQ01097 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Grin2bQ01097 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Grin2bQ01097 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Grin2bQ01097 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Grin2bQ01097 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Grin2bQ01097 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Grin2bQ01097 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Grin2bQ01097 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Grin2bQ01097 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Grin2bQ01097 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Grin2bQ01097 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Grin2bQ01097 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Grin2bQ01097 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Grin2bQ01097 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Grin2bQ01097 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Grin2bQ01097 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Grin2bQ01097 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Grin2bQ01097 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Grin2bQ01097 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Grin2bQ01097 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Grin2bQ01097 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Grin2bQ01097 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Grin2bQ01097 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Grin2bQ01097 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Grin2bQ01097 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Grin2bQ01097 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Grin2bQ01097 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Grin2bQ01097 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Grin2bQ01097 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Grin2bQ01097 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Grin2bQ01097 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Grin2bQ01097 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Grin2bQ01097 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Grin2bQ01097 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Grin2bQ01097 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Grin2bQ01097 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Grin2bQ01097 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Grin2bQ01097 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Grin2bQ01097 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Grin2bQ01097 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Grin2bQ01097 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Grin2bQ01097 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Grin2bQ01097 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Grin2bQ01097 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Grin2bQ01097 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Grin2bQ01097 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Grin2bQ01097 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Grin2bQ01097 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Grin2bQ01097 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Grin2bQ01097 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Grin2bQ01097 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Grin2bQ01097 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Grin2bQ01097 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
Grin2bQ01097 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Grin2bQ01097 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Grin2bQ01097 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Grin2bQ01097 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Grin2bQ01097 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Grin2bQ01097 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Grin2bQ01097 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Grin2bQ01097 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Grin2bQ01097 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms