Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pde1bQ01065 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms