Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms