Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms