Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PgrQ00175 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PgrQ00175 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PgrQ00175 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PgrQ00175 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PgrQ00175 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PgrQ00175 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PgrQ00175 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PgrQ00175 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PgrQ00175 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PgrQ00175 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PgrQ00175 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PgrQ00175 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PgrQ00175 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PgrQ00175 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PgrQ00175 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PgrQ00175 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PgrQ00175 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PgrQ00175 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PgrQ00175 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PgrQ00175 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PgrQ00175 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PgrQ00175 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PgrQ00175 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PgrQ00175 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PgrQ00175 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PgrQ00175 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PgrQ00175 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PgrQ00175 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PgrQ00175 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PgrQ00175 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PgrQ00175 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PgrQ00175 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PgrQ00175 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PgrQ00175 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PgrQ00175 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PgrQ00175 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PgrQ00175 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PgrQ00175 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PgrQ00175 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PgrQ00175 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PgrQ00175 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PgrQ00175 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PgrQ00175 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PgrQ00175 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PgrQ00175 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PgrQ00175 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PgrQ00175 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PgrQ00175 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PgrQ00175 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PgrQ00175 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PgrQ00175 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PgrQ00175 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PgrQ00175 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PgrQ00175 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PgrQ00175 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PgrQ00175 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PgrQ00175 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PgrQ00175 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PgrQ00175 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PgrQ00175 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PgrQ00175 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PgrQ00175 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PgrQ00175 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PgrQ00175 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PgrQ00175 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PgrQ00175 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PgrQ00175 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PgrQ00175 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PgrQ00175 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PgrQ00175 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PgrQ00175 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PgrQ00175 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PgrQ00175 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PgrQ00175 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PgrQ00175 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PgrQ00175 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PgrQ00175 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PgrQ00175 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PgrQ00175 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PgrQ00175 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PgrQ00175 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PgrQ00175 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PgrQ00175 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PgrQ00175 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PgrQ00175 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PgrQ00175 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PgrQ00175 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PgrQ00175 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PgrQ00175 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PgrQ00175 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PgrQ00175 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PgrQ00175 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PgrQ00175 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PgrQ00175 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PgrQ00175 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PgrQ00175 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PgrQ00175 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PgrQ00175 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PgrQ00175 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms