Protein–RNA interactions for Protein: P98197

Atp11a, Probable phospholipid-transporting ATPase IH, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11aP98197 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp11aP98197 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atp11aP98197 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms