Protein–RNA interactions for Protein: P97868

Rbbp6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp6P97868 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rbbp6P97868 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rbbp6P97868 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rbbp6P97868 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Rbbp6P97868 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rbbp6P97868 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rbbp6P97868 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbbp6P97868 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbbp6P97868 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbbp6P97868 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbbp6P97868 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbbp6P97868 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbbp6P97868 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbbp6P97868 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbbp6P97868 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbbp6P97868 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rbbp6P97868 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rbbp6P97868 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rbbp6P97868 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rbbp6P97868 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rbbp6P97868 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbbp6P97868 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbbp6P97868 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbbp6P97868 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbbp6P97868 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbbp6P97868 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbbp6P97868 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbbp6P97868 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbbp6P97868 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbbp6P97868 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbbp6P97868 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbbp6P97868 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbbp6P97868 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbbp6P97868 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbbp6P97868 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbbp6P97868 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbbp6P97868 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbbp6P97868 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbbp6P97868 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbbp6P97868 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbbp6P97868 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbbp6P97868 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbbp6P97868 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rbbp6P97868 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rbbp6P97868 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rbbp6P97868 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbbp6P97868 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbbp6P97868 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbbp6P97868 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbbp6P97868 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbbp6P97868 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbbp6P97868 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbbp6P97868 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbbp6P97868 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms