Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
AlkP97793 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
AlkP97793 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
AlkP97793 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
AlkP97793 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
AlkP97793 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
AlkP97793 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
AlkP97793 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
AlkP97793 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
AlkP97793 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
AlkP97793 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
AlkP97793 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
AlkP97793 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
AlkP97793 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
AlkP97793 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
AlkP97793 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
AlkP97793 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
AlkP97793 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
AlkP97793 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
AlkP97793 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
AlkP97793 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
AlkP97793 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
AlkP97793 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
AlkP97793 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
AlkP97793 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
AlkP97793 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
AlkP97793 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
AlkP97793 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
AlkP97793 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
AlkP97793 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
AlkP97793 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
AlkP97793 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
AlkP97793 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
AlkP97793 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
AlkP97793 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
AlkP97793 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
AlkP97793 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
AlkP97793 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
AlkP97793 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
AlkP97793 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
AlkP97793 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
AlkP97793 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
AlkP97793 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
AlkP97793 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
AlkP97793 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
AlkP97793 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
AlkP97793 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
AlkP97793 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
AlkP97793 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
AlkP97793 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
AlkP97793 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
AlkP97793 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
AlkP97793 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
AlkP97793 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
AlkP97793 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
AlkP97793 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
AlkP97793 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
AlkP97793 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
AlkP97793 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
AlkP97793 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
AlkP97793 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
AlkP97793 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
AlkP97793 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
AlkP97793 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
AlkP97793 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
AlkP97793 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
AlkP97793 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
AlkP97793 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
AlkP97793 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
AlkP97793 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
AlkP97793 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
AlkP97793 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
AlkP97793 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
AlkP97793 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
AlkP97793 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
AlkP97793 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
AlkP97793 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
AlkP97793 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
AlkP97793 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
AlkP97793 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
AlkP97793 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
AlkP97793 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
AlkP97793 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
AlkP97793 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
AlkP97793 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
AlkP97793 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
AlkP97793 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
AlkP97793 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
AlkP97793 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
AlkP97793 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
AlkP97793 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
AlkP97793 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
AlkP97793 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
AlkP97793 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
AlkP97793 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
AlkP97793 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
AlkP97793 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
AlkP97793 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
AlkP97793 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
AlkP97793 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms