Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gfra1P97785 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms