Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cry1P97784 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cry1P97784 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cry1P97784 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cry1P97784 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cry1P97784 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cry1P97784 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cry1P97784 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cry1P97784 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cry1P97784 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cry1P97784 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cry1P97784 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cry1P97784 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cry1P97784 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cry1P97784 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cry1P97784 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cry1P97784 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cry1P97784 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cry1P97784 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cry1P97784 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cry1P97784 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cry1P97784 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cry1P97784 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cry1P97784 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cry1P97784 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cry1P97784 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cry1P97784 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cry1P97784 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cry1P97784 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cry1P97784 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cry1P97784 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cry1P97784 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cry1P97784 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cry1P97784 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cry1P97784 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cry1P97784 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cry1P97784 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cry1P97784 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cry1P97784 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cry1P97784 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cry1P97784 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cry1P97784 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms