Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pitx2P97474 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms