Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas1P97459 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas1P97459 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Npas1P97459 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Npas1P97459 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Npas1P97459 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Npas1P97459 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Npas1P97459 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112 ms