Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Meis3P97368 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Meis3P97368 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Meis3P97368 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Meis3P97368 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Meis3P97368 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Meis3P97368 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Meis3P97368 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Meis3P97368 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Meis3P97368 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Meis3P97368 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Meis3P97368 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms