Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RhodP97348 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RhodP97348 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RhodP97348 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RhodP97348 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RhodP97348 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RhodP97348 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RhodP97348 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RhodP97348 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RhodP97348 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RhodP97348 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RhodP97348 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RhodP97348 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RhodP97348 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RhodP97348 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RhodP97348 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RhodP97348 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RhodP97348 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RhodP97348 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RhodP97348 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RhodP97348 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RhodP97348 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RhodP97348 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RhodP97348 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RhodP97348 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RhodP97348 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RhodP97348 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RhodP97348 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RhodP97348 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RhodP97348 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RhodP97348 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RhodP97348 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RhodP97348 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RhodP97348 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RhodP97348 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RhodP97348 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RhodP97348 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RhodP97348 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RhodP97348 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RhodP97348 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RhodP97348 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RhodP97348 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RhodP97348 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RhodP97348 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RhodP97348 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RhodP97348 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RhodP97348 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RhodP97348 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RhodP97348 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RhodP97348 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RhodP97348 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RhodP97348 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RhodP97348 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RhodP97348 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhodP97348 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhodP97348 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhodP97348 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhodP97348 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhodP97348 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhodP97348 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhodP97348 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhodP97348 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhodP97348 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhodP97348 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhodP97348 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhodP97348 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhodP97348 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhodP97348 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhodP97348 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhodP97348 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhodP97348 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhodP97348 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhodP97348 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhodP97348 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhodP97348 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhodP97348 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhodP97348 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhodP97348 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhodP97348 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RhodP97348 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhodP97348 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhodP97348 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhodP97348 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhodP97348 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RhodP97348 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhodP97348 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhodP97348 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RhodP97348 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhodP97348 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhodP97348 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhodP97348 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhodP97348 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhodP97348 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhodP97348 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhodP97348 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhodP97348 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhodP97348 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhodP97348 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RhodP97348 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhodP97348 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms