Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nkx2-3P97334 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nkx2-3P97334 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nkx2-3P97334 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nkx2-3P97334 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nkx2-3P97334 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nkx2-3P97334 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nkx2-3P97334 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nkx2-3P97334 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Nkx2-3P97334 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nkx2-3P97334 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nkx2-3P97334 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nkx2-3P97334 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nkx2-3P97334 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nkx2-3P97334 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nkx2-3P97334 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Nkx2-3P97334 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nkx2-3P97334 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nkx2-3P97334 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nkx2-3P97334 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nkx2-3P97334 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nkx2-3P97334 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nkx2-3P97334 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nkx2-3P97334 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nkx2-3P97334 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nkx2-3P97334 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nkx2-3P97334 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nkx2-3P97334 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nkx2-3P97334 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nkx2-3P97334 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nkx2-3P97334 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nkx2-3P97334 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nkx2-3P97334 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nkx2-3P97334 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nkx2-3P97334 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nkx2-3P97334 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nkx2-3P97334 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nkx2-3P97334 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nkx2-3P97334 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nkx2-3P97334 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nkx2-3P97334 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nkx2-3P97334 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Nkx2-3P97334 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Nkx2-3P97334 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nkx2-3P97334 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nkx2-3P97334 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nkx2-3P97334 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nkx2-3P97334 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nkx2-3P97334 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nkx2-3P97334 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nkx2-3P97334 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nkx2-3P97334 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nkx2-3P97334 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nkx2-3P97334 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nkx2-3P97334 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nkx2-3P97334 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nkx2-3P97334 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nkx2-3P97334 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nkx2-3P97334 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nkx2-3P97334 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nkx2-3P97334 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nkx2-3P97334 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nkx2-3P97334 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nkx2-3P97334 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nkx2-3P97334 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Nkx2-3P97334 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nkx2-3P97334 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nkx2-3P97334 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nkx2-3P97334 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nkx2-3P97334 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nkx2-3P97334 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nkx2-3P97334 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nkx2-3P97334 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nkx2-3P97334 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nkx2-3P97334 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nkx2-3P97334 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Nkx2-3P97334 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nkx2-3P97334 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nkx2-3P97334 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nkx2-3P97334 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Nkx2-3P97334 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nkx2-3P97334 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nkx2-3P97334 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nkx2-3P97334 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms