Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cbx1P83917 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cbx1P83917 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cbx1P83917 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cbx1P83917 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cbx1P83917 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cbx1P83917 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cbx1P83917 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cbx1P83917 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cbx1P83917 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cbx1P83917 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cbx1P83917 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cbx1P83917 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cbx1P83917 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cbx1P83917 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cbx1P83917 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cbx1P83917 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cbx1P83917 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cbx1P83917 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cbx1P83917 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cbx1P83917 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cbx1P83917 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cbx1P83917 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cbx1P83917 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cbx1P83917 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cbx1P83917 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cbx1P83917 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cbx1P83917 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cbx1P83917 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cbx1P83917 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cbx1P83917 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cbx1P83917 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cbx1P83917 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cbx1P83917 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cbx1P83917 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cbx1P83917 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cbx1P83917 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cbx1P83917 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cbx1P83917 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cbx1P83917 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cbx1P83917 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cbx1P83917 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cbx1P83917 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cbx1P83917 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cbx1P83917 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cbx1P83917 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cbx1P83917 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cbx1P83917 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cbx1P83917 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cbx1P83917 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cbx1P83917 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cbx1P83917 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cbx1P83917 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cbx1P83917 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cbx1P83917 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms