Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Irx3P81067 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irx3P81067 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irx3P81067 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irx3P81067 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irx3P81067 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Irx3P81067 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irx3P81067 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irx3P81067 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irx3P81067 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irx3P81067 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Irx3P81067 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irx3P81067 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irx3P81067 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irx3P81067 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irx3P81067 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irx3P81067 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irx3P81067 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irx3P81067 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irx3P81067 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irx3P81067 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irx3P81067 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irx3P81067 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irx3P81067 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irx3P81067 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irx3P81067 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Irx3P81067 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Irx3P81067 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Irx3P81067 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms