Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Polr1bP70700 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms