Protein–RNA interactions for Protein: P70387

Hfe, Hereditary hemochromatosis protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HfeP70387 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HfeP70387 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HfeP70387 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HfeP70387 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HfeP70387 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HfeP70387 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HfeP70387 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HfeP70387 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HfeP70387 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HfeP70387 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HfeP70387 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HfeP70387 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HfeP70387 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HfeP70387 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HfeP70387 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HfeP70387 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HfeP70387 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HfeP70387 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HfeP70387 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HfeP70387 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HfeP70387 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HfeP70387 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HfeP70387 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HfeP70387 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HfeP70387 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HfeP70387 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HfeP70387 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HfeP70387 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HfeP70387 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HfeP70387 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HfeP70387 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HfeP70387 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HfeP70387 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HfeP70387 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HfeP70387 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HfeP70387 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HfeP70387 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HfeP70387 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HfeP70387 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HfeP70387 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HfeP70387 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HfeP70387 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HfeP70387 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HfeP70387 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HfeP70387 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HfeP70387 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HfeP70387 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HfeP70387 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HfeP70387 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HfeP70387 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HfeP70387 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HfeP70387 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HfeP70387 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HfeP70387 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HfeP70387 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HfeP70387 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HfeP70387 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HfeP70387 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HfeP70387 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HfeP70387 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HfeP70387 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HfeP70387 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HfeP70387 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HfeP70387 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HfeP70387 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HfeP70387 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HfeP70387 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HfeP70387 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HfeP70387 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HfeP70387 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HfeP70387 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HfeP70387 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HfeP70387 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HfeP70387 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HfeP70387 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HfeP70387 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HfeP70387 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HfeP70387 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HfeP70387 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HfeP70387 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HfeP70387 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HfeP70387 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HfeP70387 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HfeP70387 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HfeP70387 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HfeP70387 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HfeP70387 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HfeP70387 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HfeP70387 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HfeP70387 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HfeP70387 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HfeP70387 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HfeP70387 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HfeP70387 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HfeP70387 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HfeP70387 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HfeP70387 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HfeP70387 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HfeP70387 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HfeP70387 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms