Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SeboxP70368 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SeboxP70368 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SeboxP70368 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SeboxP70368 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SeboxP70368 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SeboxP70368 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SeboxP70368 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SeboxP70368 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SeboxP70368 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SeboxP70368 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SeboxP70368 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SeboxP70368 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SeboxP70368 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SeboxP70368 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SeboxP70368 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SeboxP70368 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SeboxP70368 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SeboxP70368 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SeboxP70368 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SeboxP70368 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SeboxP70368 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SeboxP70368 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SeboxP70368 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SeboxP70368 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SeboxP70368 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SeboxP70368 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SeboxP70368 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms