Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ufd1P70362 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms