Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Msx3P70354 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Msx3P70354 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Msx3P70354 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Msx3P70354 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Msx3P70354 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Msx3P70354 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Msx3P70354 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Msx3P70354 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Msx3P70354 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Msx3P70354 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Msx3P70354 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Msx3P70354 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Msx3P70354 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Msx3P70354 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Msx3P70354 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Msx3P70354 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Msx3P70354 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Msx3P70354 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Msx3P70354 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Msx3P70354 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Msx3P70354 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Msx3P70354 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Msx3P70354 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Msx3P70354 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Msx3P70354 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Msx3P70354 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Msx3P70354 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Msx3P70354 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Msx3P70354 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Msx3P70354 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Msx3P70354 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Msx3P70354 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Msx3P70354 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms