Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smad1P70340 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smad1P70340 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smad1P70340 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smad1P70340 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms