Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tbx6P70327 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tbx6P70327 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tbx6P70327 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tbx6P70327 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tbx6P70327 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tbx6P70327 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tbx6P70327 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tbx6P70327 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tbx6P70327 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tbx6P70327 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tbx6P70327 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tbx6P70327 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tbx6P70327 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tbx6P70327 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tbx6P70327 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tbx6P70327 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tbx6P70327 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tbx6P70327 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tbx6P70327 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tbx6P70327 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tbx6P70327 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms