Protein–RNA interactions for Protein: P70314

Pitx1, Pituitary homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx1P70314 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Pitx1P70314 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pitx1P70314 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms