Protein–RNA interactions for Protein: P70295

Aup1, Ancient ubiquitous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aup1P70295 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Aup1P70295 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Aup1P70295 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Aup1P70295 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Aup1P70295 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Aup1P70295 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Aup1P70295 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Aup1P70295 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Aup1P70295 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Aup1P70295 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms