Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Stra8P70278 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Stra8P70278 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Stra8P70278 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Stra8P70278 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Stra8P70278 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Stra8P70278 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Stra8P70278 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Stra8P70278 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Stra8P70278 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Stra8P70278 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Stra8P70278 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Stra8P70278 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Stra8P70278 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Stra8P70278 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Stra8P70278 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Stra8P70278 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Stra8P70278 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Stra8P70278 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Stra8P70278 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Stra8P70278 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Stra8P70278 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Stra8P70278 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Stra8P70278 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Stra8P70278 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Stra8P70278 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Stra8P70278 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Stra8P70278 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Stra8P70278 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Stra8P70278 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Stra8P70278 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stra8P70278 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stra8P70278 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Stra8P70278 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Stra8P70278 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Stra8P70278 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Stra8P70278 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Stra8P70278 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Stra8P70278 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Stra8P70278 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Stra8P70278 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Stra8P70278 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Stra8P70278 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Stra8P70278 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Stra8P70278 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Stra8P70278 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Stra8P70278 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Stra8P70278 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Stra8P70278 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Stra8P70278 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Stra8P70278 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Stra8P70278 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Stra8P70278 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Stra8P70278 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Stra8P70278 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms