Protein–RNA interactions for Protein: P70271

Pdlim4, PDZ and LIM domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim4P70271 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdlim4P70271 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 325.4 ms