Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rad54lP70270 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rad54lP70270 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rad54lP70270 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rad54lP70270 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rad54lP70270 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rad54lP70270 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rad54lP70270 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rad54lP70270 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rad54lP70270 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rad54lP70270 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rad54lP70270 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rad54lP70270 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rad54lP70270 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad54lP70270 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad54lP70270 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms