Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NfixP70257 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NfixP70257 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NfixP70257 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NfixP70257 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NfixP70257 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NfixP70257 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NfixP70257 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NfixP70257 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NfixP70257 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NfixP70257 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NfixP70257 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NfixP70257 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NfixP70257 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NfixP70257 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NfixP70257 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NfixP70257 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NfixP70257 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NfixP70257 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NfixP70257 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NfixP70257 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NfixP70257 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NfixP70257 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NfixP70257 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NfixP70257 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NfixP70257 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NfixP70257 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NfixP70257 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NfixP70257 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NfixP70257 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NfixP70257 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NfixP70257 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NfixP70257 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NfixP70257 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NfixP70257 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NfixP70257 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NfixP70257 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NfixP70257 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NfixP70257 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NfixP70257 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NfixP70257 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NfixP70257 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NfixP70257 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NfixP70257 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NfixP70257 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NfixP70257 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NfixP70257 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NfixP70257 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NfixP70257 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NfixP70257 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NfixP70257 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NfixP70257 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NfixP70257 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NfixP70257 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NfixP70257 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NfixP70257 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NfixP70257 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NfixP70257 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NfixP70257 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NfixP70257 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NfixP70257 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NfixP70257 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NfixP70257 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NfixP70257 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NfixP70257 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NfixP70257 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NfixP70257 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NfixP70257 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NfixP70257 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NfixP70257 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NfixP70257 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NfixP70257 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NfixP70257 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NfixP70257 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NfixP70257 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NfixP70257 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NfixP70257 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NfixP70257 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NfixP70257 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NfixP70257 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NfixP70257 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NfixP70257 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NfixP70257 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NfixP70257 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NfixP70257 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NfixP70257 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NfixP70257 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NfixP70257 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NfixP70257 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NfixP70257 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NfixP70257 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NfixP70257 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NfixP70257 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NfixP70257 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NfixP70257 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NfixP70257 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NfixP70257 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NfixP70257 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NfixP70257 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NfixP70257 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms