Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Traf5P70191 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Traf5P70191 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Traf5P70191 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Traf5P70191 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Traf5P70191 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Traf5P70191 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Traf5P70191 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Traf5P70191 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf5P70191 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms