Protein–RNA interactions for Protein: P63260

Actg1, Actin, cytoplasmic 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg1P63260 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actg1P63260 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actg1P63260 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actg1P63260 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actg1P63260 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actg1P63260 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Actg1P63260 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Actg1P63260 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Actg1P63260 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms