Protein–RNA interactions for Protein: P63239

Pcsk1, Neuroendocrine convertase 1, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1P63239 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcsk1P63239 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcsk1P63239 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcsk1P63239 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcsk1P63239 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcsk1P63239 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcsk1P63239 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcsk1P63239 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pcsk1P63239 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pcsk1P63239 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcsk1P63239 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pcsk1P63239 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Pcsk1P63239 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms