Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gnb1P62874 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms