Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps28P62858 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps28P62858 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps28P62858 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps28P62858 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rps28P62858 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rps28P62858 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps28P62858 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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