Protein–RNA interactions for Protein: P62515

Pou3f4, POU domain, class 3, transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f4P62515 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms