Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms