Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Snrpd2P62317 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms